归口管理中心行政、人事、档案、财务、后勤及会务组织等工作；负责中心专家库管理工作；归口管理对地方评估机构的业务指导工作；承担全省环境影响评价和环保工程技术人员培训工作；负责开展环境影响评价技术领域国际、国内合作与交流，承办相关外事报批手续；中心网站建设、信息发布及日常维护工作等。

评估一部

主要承担水利、电力、核与辐射、机械、电子、轻工、纺织化纤、黑色金属、有色金属、金属制品、城市基础设施及房地产、农林牧渔、地质调查类建设项目环评报告技术评估工作；相关规划环评技术审核；开展相关环境管理政策、标准和技术方法等研究工作；提供环境政策技术咨询服务；协助四川省环境保护厅对环评单位的管理。

评估二部

主要承担煤炭、石油、天然气、非金属矿采选及制品制造、石化、化工、医药、公路、铁路、民航机场、水运、城市交通设施、社会事业与服务业类建设项目环评报告技术评估工作；相关规划环评技术审核；开展相关环境管理政策、标准和技术方法等研究工作；提供环境政策技术咨询服务；协助四川省环境保护厅对环评单位的管理。

排污许可与环境监理技术部

主要承担排污许可质量评估、政策及技术标准研究等综合技术工作；开展建设项目环境监理法规政策、技术标准研究等工作。

科研信息部

制定中心科研发展计划并统筹安排、组织实施；制定科研工作相关管理规定；推进科研成果转化与应用等。